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Installation de tensor2 sur une mandriva 2009 free 64

30 Octobre 2009 , Rédigé par Roger Bunivot Publié dans #mandriva

tensor2 est une logiciel permettant de déterminer diffusion rotationnelle d'une protéine à partir d'une structure 3D et des données de relaxation des 15
N

Le logiciel n'a pas besoin d'une installation mais nécessite des librairies un peu anciennes et pour processeurs 32 bit.
Il faut donc installer ces librairies:
la première: libXm.so.3 je l'ai extraite du paquage libopenmotif3-2.2.3-11mdv2007.1.i586.rpm:

rpm2cpio libopenmotif3-2.2.3-11mdv2007.1.i586.rpm |cpio -dimv

puis copié le fichier /usr/lib/libXm.so.3.0.2 en mode root  dans le répertoire /usr/lib, pour ne pas perdre de vu que c'est une librairie 32bit je l'ai renommé puis fait un lien symbolique:

su
cp /usr/lib/libXm.so.3.0.2 /usr/lib/libXm.so.3.0.2_32Bit
ln -s /usr/lib/libXm.so.3.0.2_32Bit /usr/lib/libXm.so.3

les autres librairies bien que 32 bit sont disponibles dans les sources 64 je les ai donc installées avec le gestionnaire de package.
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Installation Mathematica sur une Mandriva 2009

13 Octobre 2009 , Rédigé par Roger Bunivot

Le script d'instalation de Mathematica,
Mathematica_7.0.1_LINUX_MachineSpecific.sh
cherche en toute fin d'installation le programme "id".
Le problème c'est qu'il le cherche dans /usr/bin
et que Mandriva l'a mis dans /bin
Pour corriger ce problème on peut faire un lien symbolique de la manière suivante:


ln -s /bin/id /usr/bin/
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Installation nmrPipe

6 Octobre 2009 , Rédigé par Roger Bunivot Publié dans #nmrpipe

Après une mise a jour de mandriva 2009 vers la derniere version; au lancement de nmrDraw j'avais le droit à cette erreur:

nmrdraw: xcb_io.c:378: _XAllocID: Assertion `ret != inval_id' failed.
Abort



La solution donné par Frank Delaglio consiste à installer la dernière version de nmrPipe.

L'installation ce fait facilement, en suivant les indications du site,
http://spin.niddk.nih.gov/NMRPipe/install/ :
après téléchargement des fichiers,
dyn.tz
NMRPipeX.tZ
talos.tZ
binval.com
install.com
changer les droits, et lancer du script d'installation.

chmod a+r  *.tZ
chmod a+rx *.com
./install.com

Au lancement de nmrDraw, on obtient une nouvelle erreur impliquant un problème de font:
X Error of failed request:  BadFont (invalid Font parameter)       
  Major opcode of failed request:  94 (X_CreateGlyphCursor)        
  Resource id in failed request:  0x0                              
  Serial number of failed request:  40                             
  Current serial number in output stream:  42


qui est corrigé en installant le package:
x11-font-sun-misc
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