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Articles avec #nmrpipe tag

Installation nmrPipe

6 Octobre 2009 , Rédigé par Roger Bunivot Publié dans #nmrpipe

Après une mise a jour de mandriva 2009 vers la derniere version; au lancement de nmrDraw j'avais le droit à cette erreur:

nmrdraw: xcb_io.c:378: _XAllocID: Assertion `ret != inval_id' failed.
Abort



La solution donné par Frank Delaglio consiste à installer la dernière version de nmrPipe.

L'installation ce fait facilement, en suivant les indications du site,
http://spin.niddk.nih.gov/NMRPipe/install/ :
après téléchargement des fichiers,
dyn.tz
NMRPipeX.tZ
talos.tZ
binval.com
install.com
changer les droits, et lancer du script d'installation.

chmod a+r  *.tZ
chmod a+rx *.com
./install.com

Au lancement de nmrDraw, on obtient une nouvelle erreur impliquant un problème de font:
X Error of failed request:  BadFont (invalid Font parameter)       
  Major opcode of failed request:  94 (X_CreateGlyphCursor)        
  Resource id in failed request:  0x0                              
  Serial number of failed request:  40                             
  Current serial number in output stream:  42


qui est corrigé en installant le package:
x11-font-sun-misc
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nmrPipe sur mandriva 2009

20 Décembre 2008 , Rédigé par Roger Bunivot Publié dans #nmrpipe

J'ai eu quelques problème pour installer nmrPipe sur ma mandriva 2004.
J'ai voulu l'installer dans un répertoire type /usr/local/logiciel/NMRPipe/
Donc un répertoire disponible depuis root uniquement.
Depuis mandriva 2009 il est impératif pour passer root et pouvoir installer le programme, taper

su -

suivre les indications de fichiers INSTALL
"notamment l'utilisation d'un shell C"
(installer tcsh avant d'installer nmrPipe)
changer de shell:

tcsh

executer le programme d'installation:

./install.com chemin_complet_du_dossier_contenant_les_executables

ensuite les fontes ne sont pas disponibles, et la date a surement expirée donc voici mon fichier .cshrc à mettre dans le dossier:
/home/utilisateur

#to correct the expiration error
setenv NMR_CONT CORRECT

#   In order to use the new software, users must first execute
#   an initialization  script,  for  instance  by  adding  the
#   following command to their .cshrc file:

     if (-e /usr/local/logiciels/NMRPipe//com/nmrInit.linux9.com) then
        source /usr/local/logiciels/NMRPipe//com/nmrInit.linux9.com
     endif

#   In order to use DYNAMO options, users must first execute
#   an initialization  script,  for  instance  by  adding  the
#   following command to their .cshrc file:


     if (-e /usr/local/logiciels/NMRPipe//dynamo/com/dynInit.com) then
        source /usr/local/logiciels/NMRPipe//dynamo/com/dynInit.com
     endif

# for the font

     if (-e /usr/local/logiciels/NMRPipe//com/font.com) then
        source /usr/local/logiciels/NMRPipe//com/font.com
     endif



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